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不管有沒有使用處理,建議所有的樣品在進樣經過過濾或是離心處理。例如當樣品經過濾膜可以濾除顆粒從而減少堵塞色譜柱的篩板,濾膜的孔隙大小必須小于色譜柱的篩板孔徑大小。般大于3 μm顆粒的色譜柱使用2 μm大小的篩板,3 μm顆粒的色譜柱則使用0.5 μm的篩板,而小于3 μm顆粒的色譜柱般使用0.2 μm的篩板,因此通用的0.45 μm的濾膜基本可以用在除了亞2 μm顆粒以外所有的色譜柱;對于亞2 μm顆粒的色譜柱,般使用0.2 μm大小孔隙的濾膜。大多濾膜是事先封裝好,可以直接接在注射器進行過濾或是作為96孔板的過濾板。
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