考馬斯亮藍有G250和R250兩種，在顏色索引（Colour Index）中給出了不同的編號（42655和42660）。亮藍G和亮藍R在冷水中分別為微溶和不溶，在熱水和乙醇中分別為可溶和微溶。兩種染料均能對固定的蛋白進行有效地染色，使用濃度為溶于甲醇:冰醋酸:水（50:10:40）的0.05%溶液�？捡R斯亮藍G250與蛋白質的結合反應十分迅速，是常用的蛋白染料，染色后為藍綠色，常用來作為蛋白質含量的定量測定�？捡R斯亮藍R250與蛋白質結合雖然比較緩慢，但是燃料可以穿透凝膠，染膠效果好，染色后為紅藍色，且可以被洗脫下去，所以可以用來對電泳條帶染色。G250也可染膠，但染色過程慢且染色后背景高，脫色困難。
考馬斯亮藍R250（Coomassie brilliant blue R-250）為三苯基甲烷（triphenylmethane），每個分子含有兩個SO3-H基團，本身偏酸性，磺酸基與蛋白質的堿性基團結合形成染料-蛋白質復合物。MW=824，λmax=560-590nm�？捡R斯亮藍R-250是通過范德瓦爾鍵與蛋白質結合，可以被洗脫下去，尤其適用于SDS電泳微量蛋白質染色，染色靈敏度比氨基黑高5倍。它與不同蛋白質結合呈現出基本相同的顏色，并且在比較寬的范圍內（15-20g），掃描峰的面積與蛋白量呈線性關系。但蛋白質濃度超出一定范圍時，對高濃度蛋白的染色不符合Beer定律，用作定量分析時要注意這點。
考馬斯亮藍G250（Coomassie brilliant blue G-250）為二甲花青亮藍（xylene cyanine brilliant blue），是一種甲基取代的三苯基甲烷。比考馬斯亮藍R250多二個甲基，MW=854；λmax=590-610nm，游離狀態下呈紅色。染色靈敏度不如R250，但比氨基黑高3倍。其優點在于它在三氯乙酸中不溶而以膠體形式存在，能選擇性地和蛋白質形成復合物，染色迅速，著色深的蛋白質區帶在數秒內即可顯現出來，約45分鐘后著色最深，成本低，重復性好。當它與蛋白質結合后變為青色，蛋白質-色素結合物在595nm波長下有最大光吸收。其光吸收值與蛋白質含量成正比，因此可用于蛋白質的定量測定。蛋白質與考馬斯亮藍G-250結合在2min左右的時間內達到平衡，完成反應十分迅速；其結合物在室溫下1h內保持穩定。該法是1976年Bradford建立，試劑配制簡單，操作簡便快捷，反應非常靈敏，靈敏度比Lowry法還高4倍，可測定微克級蛋白質含量，測定蛋白質濃度范圍為0～1,000μg/mL，是一種常用的微量蛋白質快速測定方法。。
考馬斯亮藍法測定蛋白質含量流程
該方法用于大多數蛋白質的定量是比較精確的，但不適用于小分子堿性多肽的定量。如核糖核酸酶或溶菌酶。去污劑的濃度超過0．2％影響測定結果。如TritonX-100、SDS、NP-40等。
1．Bradford濃染液的配制：將100rug考馬斯亮藍G-250溶于50m1 95％乙醇，加入100ml濃磷酸，然后，用蒸餾水補充至200ml，此染液放413至少6個月保持穩定。
2．標準曲線蛋白質樣本的準備：盡量使用與待測樣本性質相近的蛋白質作為標準品，例如測定抗體，可用純化的抗體作為標準。如果待測樣本是未知的，也可用抗體作為標準蛋白。通常在20ug—150ug／100ul之間繪制標準曲線。
3．將待測樣本溶于100~1緩沖溶液中，該緩沖溶液應與制作標準曲線的緩沖溶液相同（最好用PBS）。
4．按1：5用蒸餾水稀釋濃染料結合溶液，如出現沉淀，過濾除去。
5．每個樣本加5ml稀釋的染料結合溶液，作用5～30rain。染液與蛋白質結合后，將由紅色變為藍色，在595nm波長下測定其吸光度。注意，顯色反應不得超過30min．
6．根據標準曲線計算待測樣本的濃度。
考馬斯亮藍和皮膚中蛋白質通過范德華力結合，反應快速，并且穩定，無法用普通試劑洗掉。待一兩周左右，皮屑細胞自然衰老脫落即可無礙。
考馬斯亮藍R-250是電泳專用的
考馬斯亮藍G250和R250都可以染蛋白，一般用R250，G250染色后背景較深不易脫色。一般R250 染蛋白，G250 一般測蛋白濃度，也可染膠，敏感性更高但較慢脫色較難。
考馬斯亮藍G250常用的蛋白染料，作定性試驗用,染色后為藍綠色;R250較敏感,做定量實驗用,染膠效果較好.染色后為紅藍色。
