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齊一生物：對60706個體進行外顯子組測序，揭示全球遺傳變異的模式
點擊次數：243 發布時間：2016/8/20
由悉尼大學的Monkol Lek博士和麻省理工學院Broad研究所的丹尼爾·麥克阿瑟博士和哈佛大學領導的研究，通過對擁有不同地域的祖先的60706個個體進行外顯子組測序，揭示了全球遺傳變異的模式。這些地域包括歐洲、非洲、南亞、東亞和拉美，結果發表在今天的《自然》雜志上。
利用大量由外顯子組聚集聯盟（EXAC）提供的外顯子組測序數據，該研究小組確認了約740萬處遺傳變異，提供了前所未有的、在人群中低頻編碼蛋白的變異體。EXAC將60706名互不相關的個體的外顯子組數據進行分類，這些數據通過眾多疾病特異性和種群遺傳學研究測序所得。EXAC的網站訪問量已經超過520萬次，目前每周有7萬的頁面瀏覽量。
在新一期的《自然》雜志的子分析中，作者分析了其他研究中報告的192種致病變種，只有九個具有足夠的數據支持如下結論：這些變體有強烈的疾病相關性。
“人類遺傳變異的大型參考數據集是破譯醫學和功能相關性DNA序列改變的關鍵。”Lek博士說。
“這個分析揭示了遺傳變異的全球性模式，提供了小的遺傳變異數據集無法解析的全球模式。”
外顯子測序是用于測序編碼蛋白基因的方法。人類約有180,000個外顯子，構成了人類基因組的百分左右，或大約30萬個堿基對。
已知的遺傳變異性疾病中，四分之三位于編碼蛋白質的外顯子組中�？紤]到測試所有基因組序列的成本和分析數據所面臨的技術難題，研究人員正將他們的大部分研究集中在外顯子測序方面。
解讀結果是基因測序中的核心挑戰。每個外顯子組包含大約13500個單核苷酸變體，這些變體改變了氨基酸。這些變體中的大部分是功能性變體。醫學研究人員的艱巨任務，是區分那些病理性變體，含有這些變體的患者往往很少或沒有可檢測的臨床后果。
