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中科院昆明動物所等發布新款基因測序軟件
點擊次數：329 發布時間：2016/6/18
中科院昆明動物研究所研究員馬占山與美國馬里蘭大學葉承曦博士在基因測序領域的合作再次取得重要突破。合作團隊近日正式發布了一款代號為 Sparc 的軟件。
針對第三代基因測序儀硬件錯誤率高達15%~40%的問題，該團隊研發出了一套“線性復雜度”（復雜性）的算法，Sparc軟件即基于該新算法完成。綜合測試顯示：采用測序深度僅為30x的三代基因測序數據，Sparc取得組裝共識（Consensus）時錯誤率低于0.5%；同時與目前*優秀的同類軟件相比，Sparc可節省計算時間和內存達80%。這一重要突破為推進基因測序技術邁向三代技術的產業升級提供了又一關鍵軟件技術。
Sparc 研發獲得了中科院、遺傳資源與進化國家重點實驗室、國家自然科學基金以及云南省高端科技人才、海外高層次人才、云嶺產業領軍人才以及創新團隊等項目的支持。由于該研究屬于計算機科學、數學和生物學的交叉領域，因此創新團隊成員間的跨界合作自然起到了關鍵作用。
