藻紅蛋白(B-PE)具有三個吸收帶,在545nm處具有zui大吸收。 B-PE的亞基結構類似于R-PE,但亞基的發色團含量不同,導致吸收峰的相對強度不同:α和β亞基僅含有PEB,而γ亞基含有PEB和PUB。 B-PE存在于藍細菌和紅藻中。 B-PE的強烈粉紅色和橙色熒光幾乎與肉眼無法區分的R-PE。別藻藍蛋白在主要的藻膽蛋白中是zui不穩定的,在低濃度下易于解離,包括進行某些測定的濃度。 出于這個原因,許多研究人員更喜歡使用在α和β亞基之間化學交聯的CL-APC,并且比APC更穩定。

藻紅蛋白(R-PE)從紅藻中分離。其主要吸收峰位于565nm,第二峰位于496nm和545nm。 次生峰的相對突出性在來自不同物種的R-PE之間顯著不同。R-PE具有三種類型的亞基:α(~20,000道爾頓),β(~20,000道爾頓)和γ(~30,000道爾頓)。已發現完整R-PE的分子量為約240,000道爾頓,并且已確定(αβ)6γ的亞基結構。R-PE的α亞基僅含有藻紅蛋白(PEB)發色團,而β和γ亞基含有PEB和藻藍蛋白(PUB)。來自不同物種的R-PE的吸收光譜的可變性反映了亞基的PEB / PUB比率的差異。R-PE和密切相關的B-PE是zui強熒光的藻膽蛋白,其量子效率可能超過90%,并且在任何中等濃度的溶液中,其橙色熒光很容易被肉眼看到。

艾美捷AAT-2554別藻藍蛋白 是由藻膽蛋白提取出的一種熒光染料。藻膽蛋白由許多亞基組成,每個亞基具有蛋白質骨架,線性四吡咯發色團與其共價結合。藻紅蛋白(紅色)和藻藍蛋白(藍色)是兩種主要的藻膽蛋白。

艾美捷AAT-2554別藻藍蛋白：

消光系數（cm -1 M -1） 700000

激發（納米） 651

發射（納米） 660

艾美捷AAT別藻藍蛋白光譜特性：

艾美捷AAT別藻藍蛋白參考文獻：

Evaluation of Tolypothrix germplasm for phycobiliprotein content

Authors: Prasanna R, Prasanna BM, Mohammadi SA, Singh PK.

Journal: Folia Microbiol (Praha) (2003): 59

Co-ordinated expression of phycobiliprotein operons in the chromatically adapting cyanobacterium Calothrix PCC 7601: a role for RcaD ａnd RcaG

Authors: Noubir S, Luque I, Ochoa de Alda JA, Perewoska I, T ａnd eau de Marsac N, Cobley JG, Houmard J.

Journal: Mol Microbiol (2002): 749

Phycobiliprotein genes of the marine photosynthetic prokaryote Prochlorococcus: evidence for rapid evolution of genetic heterogeneity

Authors: Ting CS, Rocap G, King J, Chisholm SW.

Journal: Microbiology (2001): 3171