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              西南大學等解析斜紋夜蛾基因組齊一生物編

              點擊次數:254 發布時間:2017/9/27
               9 月 25 日,由西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗發起并主持,聯合法國、日本、印度、比利時和美國等多家研究機構參與的鱗翅目害蟲斜紋夜蛾基因組相關研究成果于 Nature 子刊《自然—生態學與進化》上在線發表。該研究成果揭示了斜紋夜蛾的高質量基因組精細圖譜,以及群體變異圖譜和基因表達圖譜。
               
              斜紋夜蛾,又稱東方夜蛾,是一種廣食性和暴食性農林害蟲,危害近 100 科的 300 余種植物,主要分布于亞洲和大洋洲的熱帶和亞熱帶地區,具有高繁殖力和短周期等特征,近年來在我國長江流域和沿海地區爆發頻率明顯增加,給農業尤其是蔬菜生產造成嚴重損失。
               
              斜紋夜蛾基因組計劃由該校“外專千人計劃”特聘專家三田和英牽頭組織實施,研究歷時 5 年。研究人員首先構建了一個 20 多個世代的斜紋夜蛾自交品系,采用單個體基因組樣本和全基因組鳥槍法方法,對斜紋夜蛾基因組進行測序和組裝,獲得 3597 條 Scaffold 序列(N50=915kb),采用簡化基因組測序策略,構建高密度分子遺傳圖譜,組裝獲得 31 條染色體和大小約 438Mb 的斜紋夜蛾基因組精細圖譜;蜃⑨尗@得了 15317 個蛋白質編碼基因,比較基因組分析揭示化學物質感受、解毒及殺蟲劑抗性等相關基因相對于寡食性昆蟲的拷貝數顯著增加。印度、日本、中國熱帶和亞熱帶地區等地區的害蟲群體分析顯示廣泛的基因交流,表明斜紋夜蛾是長距離遷徙擴張和強適應性的農業害蟲。

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