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用循環 DNA 進行早期癌癥的非創傷性檢測
全球每年有超過 1400 萬人被診斷罹患癌癥,他們中的大多數都是在癌癥發展到晚期的時候才被發現的,這時可供選擇的治療已經非常少了。因此,結腸直腸癌、卵巢癌、肺癌和乳腺癌的早期發現及給予臨床干預或能每年挽救多達 100 萬人的生命。Jillian Phallen 和同事研發出了識別癌癥分子特征的超敏感方法,這些分子特征來自癌細胞釋放到血液中的小片遺傳物質,它們被稱作循環腫瘤 DNA(ctDNA)。
與采自 44 名健康人的樣本不同,采自 194 名結腸直腸癌、卵巢癌、肺癌和乳腺癌患者的血漿中經常含有 ctDNA,后者在 58 種所謂的癌癥驅動基因中含有 1 種或以上的基因突變。鑒于 ctDNA 只占存在于血液中的全部 DNA(被稱作無細胞 DNA,或 cfDNA)中的極小比例,因此科學家們研發了一種新型的樣品制備方法和計算分析管道,他們稱其為 TEC-Seq。
通過對每個分子進行數萬次測序,研究人員能挑出 ctDNA,并在 cfDNA 中區別癌癥相關性突變和正常變異,其假陽性率低于 3 百萬分個堿基對。平均而言,癌癥病人血液中的總體 cfDNA 要比健康受試者多 4 倍,而其濃度增加與癌癥侵襲性增加相關。作者說,對更廣泛的驅動基因進行分析或能進一步增加 TEC-Seq 的敏感性和特異性。