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研究揭示了44個與偏頭痛風險相關的SNP齊一生物報
點擊次數：188 發布時間：2016/6/24 10:50:12
頭痛基因組學聯盟（International Headache Genetics Consortium）的研究人員對22項GWAS研究進行了meta分析，并揭示了44個與偏頭痛風險相關的SNP，定位到38個基因位點，其中包括28個新位點，這些位點富集的基因都在血管和平滑肌組織中表達。研究結果發表在《Nature Genetics》雜志上。
來自馬薩諸塞州總醫院和哈佛醫學院的Aarno Palotie 和他的同事們在文章中寫道，“研究中鑒定出的38個基因組位點佐證了一種說法，血管和平滑肌組織中的因子與偏頭痛病理學相關，兩種主要的偏頭痛類型（先兆偏頭痛和無先兆偏頭痛）有一些共享的潛在遺傳易感基因。”
38個偏頭痛相關易感位點
Palotie和他的同事們收集了22項GWAS研究結果，包含了將近6萬個患有先兆偏頭痛或無先兆偏頭痛的人，以及31.6萬個對照，所有研究對象都是歐洲血統。他們利用千人基因組計劃的參考panel填補缺失的基因型。
在初步分析中，研究人員對800多萬個變異進行檢測，檢測到44個全基因組范圍內獨立的顯著SNP。將鄰近的關聯位點合并后，他們發現了與偏頭痛相關的38個基因組位點，其中28個為新發現的與偏頭痛相關的位點。研究人員表示，之前研究中發現的與偏頭痛相關的13個位點中有10個得到了驗證。
研究人員還進行了偏頭痛亞型的關聯分析。偏頭痛中*常見的一種類型為無先兆偏頭痛，他們對這種類型進行分析鑒定出了7個顯著位點，這7個位點在初步分析中就被發現。然而他們并未發現任何與先兆偏頭痛特異相關的位點，這可能是因為其樣本規模較小。異質性分析結果顯示大部分發現的位點與這兩種偏頭痛亞型均相關。
偏頭痛與血管和平滑肌組織中的因子相關
研究人員表示，這38個基因位點中84%都與蛋白編碼基因轉錄本重疊，這些重疊區中45%的區域僅含有1個基因。這38個基因位點中僅2個與離子通道基因相關，降低了偏頭痛可能是一種離子通道病這種假說的可能性。
這些相關基因中很多都曾被報道與血管疾病相關，例如PHACTR1、TGFBR2和HEY2，而其他基因則與平滑肌收縮和調節血管張力相關，例如MRVI1、GJA1和NRP1。
利用基因型-組織表達聯盟（Genotype-Tissue Expression Consortium）項目的數據，研究人員發現一些疾病相關基因在某些組織中表達量更高。例如GPR149、 CFDP1和DOCK4在大腦中高表達，PRDM16、MEF2D和FHL5在血管組織中高表達。
Palotie和他的同事們還尋找了這38個偏頭痛相關基因高表達的組織�；谶@個分析，他們發現表達的組織是部分心血管系統，而消化系統同樣也出現了基因富集。他們利用DEPICT工具和獨立的芯片數據集重復得到了這個結果。
進一步利用GO過表達分析和基于DEPICT的二次分析，這些證據同樣表明了心血管組織的相關性。研究人員指出，這些與血管組織相關的發現，與偏頭痛并發癥以及之前報道過的偏頭痛、中風和心血管疾病共享多基因風險是一致的。
Palotie和他的同事們寫道，“這些結果表示血管功能障礙和平滑肌功能障礙都與偏頭痛發病機制相關。”然而，他們還補充道，神經機制同樣可能與偏頭痛相關。
參考文獻：Meta-analysis of 375,000 individuals identifies 38 susceptibilityloci for migraine. Nature Genetics （2016） doi:10.1038/ng.3598
原創作者：齊一生物科技（上海）有限公司
