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Taq DNA聚合酶,你了解多少嗎?
在PCR反應中,毫無疑問的DNA聚合酶是*關鍵的因素。PCR*初使用的DNA聚合酶是大腸桿菌DNA聚合酶 I的Klenow片段。但該酶存在很多缺陷,使之不能廣為應用,比如:熱穩定性差,每次DNA熱變性后大部分酶都被滅活,需要重新加入,每個循環都要重新加入;Klenow酶反應溫度較低,引物和模板容易形成非特異性配對,產生非特異性擴增。后來人們曾使用過T4DNA聚合酶和T7DNA聚合酶,兩者雖使擴增特異性增加,且使DNA合成速度提高了,但是由于其對熱的穩定性差而未能廣泛應用。直到耐熱的DNA聚合酶發現,才使得PCR技術得到迅速的發展和廣泛的應用。
Taq DNA 聚合酶是從一種嗜熱水生菌Thermus aquaticus YT-1菌株中分離提純得到的。是1969見從美國黃石國家森林公園火山溫泉中分離得到的,它生長在70~75℃極富礦物質的環境中。
Taq DNA 聚合酶基因全長為2496堿基,編碼832個氨基酸,酶蛋白分子量為94KD。該酶在70~75℃時具有的生物活性。75~80℃條件下每一個酶蛋白分子每秒可延伸約150個堿基。70℃時,酶分子延伸速率每秒在60個堿基以上。溫度降低時,延伸速率明顯下降。55℃時為每秒22個堿基,37℃時約每秒1.5個堿基,22℃時約每秒0.25個堿基。當溫度超過80℃時,合成速度也明顯下降,這可能和引物或引物-模板復合物的穩定性遭到破壞有關。
Taq DNA 聚合酶具有良好的熱穩定性。曾有測試:在92.5℃、95℃、97.5℃下,Taq DNA 聚合酶的生物半衰期分別為130分鐘、40分鐘和5~6分鐘。與大腸桿菌DNA聚合酶I相比較,Taq DNA 聚合酶具有5’→3’聚合酶活性和5’→3’外切酶活性,缺乏3’→5’外切酶活性。因此,在PCR反應中如果發生某些氨基酸的錯配,這種酶是沒有修正功能的。使用Taq DNA聚合酶的PCR反應出現堿基錯配的幾率為2.1×10-4左右。
和其他許多聚合酶一樣,Taq DNA聚合酶是Mg2+依賴性酶,該酶的催化活性對Mg2+濃度非常敏感。以鮭魚精子DNA為模板,dNTP的濃度為0.7~0.8 mmol/L時,用不同濃度Mg2+進行PCR反應10min,測定結果為MgCl2濃度在2.0 mmol/L時該酶催化活性,此濃度能限度地激活Taq DNA聚合酶的活性,Mg2+過高就抑制酶活性,當MgCl2濃度在10 mmol/L時可抑制40~50%的酶活性。由于Mg2+能與dNTP結合而影響PCR反應液中游離的Mg2+濃度,因而MgCl2的濃度在不同的反應體系中應適當調整。一般反應中Mg2+濃度至少應比dNTP總濃度高0.5~1.0mmol/L。另外適當濃度的KCl能使Taq DNA聚合酶的催化活性提高50~60%,其*適濃度為50mmol/L,高于75mmol/L時明顯抑制該酶的活性。
原創作者:上海遠慕生物科技有限公司