實驗室較為理想的布局模式為有一個專用走廊，試劑準備區、樣品制備區、擴增區和產物分析區很規范地排列在一起，前三個區各有一個緩沖間，可供換工作服和工作鞋使用，頂上可裝一紫外燈。內實驗區域設為正壓或常壓狀態，緩沖間內設為負壓狀態（可上設一抽風裝置），使這三個區的空氣流向為由實驗區域內向外，緩沖間內通向內實驗室和走廊的門可安裝一種連鎖裝置，當一個門打開時，另一門必須處于關閉狀態，防止出現兩個門同時打開的情況。產物分析區可不設緩緩沖間，但應設為負壓狀態（裝—個排風扇即可），使空氣流向由外向內，以防止擴增產物的隨空氣流出。每一區域都須有明確的標記，工作按試劑準備區、樣品制備區、擴增區至產物分析單—流向進行，各區的儀器設備包括工作服、鞋、實驗記錄本和筆等都必須專用。如果無法做到以上模式，以下基本要求必須做到：

（1）四個區域必須是相互獨立的。  

（2）各區的儀器設備及各種物品必須是專用的。  

（3）各區完全獨立，緩沖間可有可無。如為一個區套一個區的模式，區間不能直通，應有緩沖間，供換工作服及鞋子用，并保證兩個區域間始終處于完全的分隔狀態

（4）產物分析區應安裝排風扇或其他抽風裝置，維持負壓。